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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系都可以设别肉瘤聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系表层的主耍聚集化相融性组合体(MHC)呈递的抗原而启用免疫抗体检测检测想法。MHC I类(MHC-I)原子结构与CD8+ T聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系主动目的,其呈递的肽主耍出自于于于内源性胞质血清的血清酶体溶解,而MHC II类(MHC-II)原子结构主耍表示于靠谱抗原提呈聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系,与CD4+ T聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系主动目的,其呈递的肽出自于用内体手段溶解的胞外和胞内血清(图1)。这样,设别由MHC原子结构呈递的肉瘤抗原对於设计依靠T聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系设别和烧死肉瘤聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系的有效地和稳定的癌症晚期免疫抗体检测检测方式是至关极为重要的。根据质谱(MS)的免疫抗体检测检测肽组学(Immunopeptidomics)都可以从多个聚集化血神经聚集体癌上皮细胞系系、肉瘤聚集化和稳定聚集化中mtk量、随时鉴定费MHC紧密联系肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原丰度MHC简答运用肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫力肽回文序列同时译为后表达内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo上上下下测序科技,不依赖现有数据库,更大通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多种多样的的数据讲解内部为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递癌症抗原的有效途径

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 研究的流程

NO.2 货品特征

NO.3 浅析相关内容(地方)

NO.4 送样提案

案例分享一下分析一下

01 体系研究分析

短文主题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

发过杂志网站:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)有的是种核伤害淀粉酶,在恶性淋巴肿瘤中不时过展现,做以为淋巴肿瘤造成的能够环境因素。当前,靶点XPO1的小团伙正被代替诊疗治癌类药。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 一个原自XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肉瘤-免疫检测改善

优秀文章提题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

提出报刊内容:Nature Communications IF:16.6 2023

恶性瘤胸膜间皮瘤(MPM)一种愈后不好的侵蚀性性淋巴肿瘤。主要是因为替换成的中药制疗预案贫乏效用,因为迫在眉睫须得新的中药制疗思路。考虑到其T癌细胞侵润,写作者有效市场理论MPM一个应该的中药制疗性癌证肺炎疫苗的的目标。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用对于质谱的免疫检测肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶意胸膜间皮瘤免疫细胞肽组学查测

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 细菌和病毒mRNA役苗联合开发

原创文章小题目:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

收录报刊内容:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过立于质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌影响的Hela神经内部和HCT-116神经内部中鉴定费MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱工作小结

天然免役性抗体性肽组学是蛋清质组学的一家短时间提升的派系,它用心打造于研发天然免役性抗体性体系中由重点团队相溶性组合体(MHC)或人类白血聚集计数膜抗原(HLA)氧分子呈递的天然免役性抗体性肽。许多天然免役性抗体性肽是血聚集膜外面呈递的肽段,都可以被T血聚集膜识别系统,导致解锁天然免役性抗体性生理变化反应。体系结构质谱的天然免役性抗体性肽组学现在已经将成为鉴定费会MHC蛋清呈递肽的金条件方法步骤,都可以随便鉴定费会各不相同于生理变化和病理报告情形下各不相同于团队和血聚集膜形式中的天然免役性抗体性肽组,比如实际瘤或病原体细菌感染的血聚集膜。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫验测肽组验测服务于,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,可能准确无误且随时给出抗体细胞肽字段,知道更加多非举例抗体细胞肽,逐层淘汰出可信度新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

基准医学文献

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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