
2024年9月由杭州农林学校张万刚院士团队图片在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生态学为该研究提供了亚硝基化突显组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文版小标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
刊物:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2028年引响指数公式:5.7
发布日子:2024年9月
的客户企事业单位:南京农业大学
的研究村料:蛋白
拜谱带来了技巧:亚硝基化修饰组学
方法线路:
一、设计导致
01.Caspase-3可溶性
现有尚不清理NO对caspase-3的减缓帮助是否是归因于NO介导的S-亚硝基化,有所不同氨水浓度梯度方向的GSNO是外源性NO厂家直销,以成脂caspase-3的离体S-亚硝基化。后果说明,与如果没有GSNO的组相对于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3催化几丁质酶重要影响(图1),与事先报道范文同样。GSNO治理影响caspase-3催化几丁质酶的因素现象仍仍待指出。
图1 的不同氧化还原电位的GSNO外理对caspase-3特异性的影响到
02.Caspase-3的S-亚硝基化情况
科学探求分析Caspase-3的亚硝基化层度,以相高度GSNO对Caspase-3的反映性。经GSNO治理后,判断到caspase-3血清S-亚硝基化抗拉强度扩大(图2)。某些但是呈现,外源性GSNO培育可完美帮助caspase-3的身体之外S-亚硝基化。最让人惊愕的是,在找不到GSNO留存的比较组中判断到一款 不大的S-亚硝基化带,这呈现caspase-3也许发生的内源性的S-亚硝基化。显然,本科学探求分析中caspase-3的S-亚硝基化层度较高,而caspase-3的吸附性缩减,这与此前的科学探求分析高度。但是,caspase-3的非特异聊天S-亚硝基化表达位点尚不非常清楚,还应该进第一步的探求。
图2 GSNO处置对caspase-3S-亚硝基化平行的决定
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化掩盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。蓝色系标志的队列认为S-亚硝基化肽,橙红色标志的C认为S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结血清
结血清用作属于注重的上皮受损细胞骨架血清,在长期保持肌上皮受损细胞构造的构造完美性和缩水性工作方面起着注重功效,研究分析S-亚硝基化caspase-3对结血清分解的灵敏性享有注重积极意义。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的初使肌玻璃纤维棉血清)组相较于,0 μM GSNO组(肌原玻璃纤维棉和caspase-3的孵育,无GSNO)的完美结血清含铁更为严重减轻,提示信息caspase-3对结血清享有隐性的血清溶解效率。在GSNO孵育后,完美结血清的含铁严重延长(P < 0.05)。因此,当GSNO质量浓度增加时,完美结血清的含铁持续性调整(P < 0.05)(图5)。这种得知表示,SNO掩盖的caspase-3以横向依懒的方试控制结血清的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3挥发结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3降解塑料肌钙血清-T
肌钙球蛋清酶-T (TnT)是原肌球球蛋清酶调低复杂手臂肌肉收縮的丝条的必需品肌原黏胶食物弹性纤维球蛋清酶。TnT的吸附的特点是检验到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化原因下,caspase-3对TnT的吸附原因如图甲如下图所示6如下图所示,与Std组(不标caspase-3和GSNO的肌原黏胶食物弹性纤维)比起,caspase-3组中30 kDa TnT情节比较突出扩大,反映caspase-3参入了TnT的吸附,还有,caspase-3与GSNO的孵育然而产生30 kDa TnT回落。在100和200 μM GSNO组区间内不会有检验到比较突出的差别(P > 0.05),而当GSNO的浓度值可达400 μM 时,该情节比较突出下降(P < 0.05)。这一些感觉反映了SNO淡化的caspase-3对TnT吸附的压制作方法用。结球蛋清酶和TnT是caspase-3的比较敏感底物,而GSNO处里减低caspase-3的吸附性酶类概率然而产生肌原黏胶食物弹性纤维球蛋清酶吸附层面减低。以上所说,NO引诱的S-亚硝基化还可以采用淡化半胱氨酸残基来调低caspase-3的吸附性酶类,而能进步骤影晌其对结球蛋清酶和TnT的球蛋清酶蛋白质水解水平,然而影晌牛羊肉品级。
图6. S-亚硝基化caspase- 3化学降解肌钙淀粉酶-T
二、总结ppt
本研究方案宗旨在研究方案S-亚硝基化对caspase-3装饰的影晌极其其次对羊肉肌原棉仟维身体降解塑料的影晌。血清S-亚硝基化应该装饰caspase-3的半胱氨酸残基,于是会造成caspase-3几丁质酶降低,进两步克制了其对羊肉肌原棉仟维血清的血清溶解效果。三、拜谱总结
探析按照了酶活了解,亚硝基化淡化组学了解,WB等的检测的方式,察觉球球血清S-亚硝基化可以淡化caspase-3的半胱氨酸残基,这造成的了caspase-3生物的变低,齐头并进步骤减弱了其对鸡肉肌原弹性纤维球球血清的球球血清水解反应能力素质。本探析为释义球球血清质亚硝基化对肉质地的国家宏观调控管理机制保证半个个新的视域。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球膳食纤维组学、装饰球膳食纤维组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸型号货品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total硫化抹除、游离子巯基,欢迎大家咨询!
基准文献资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663