
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析效果
探析成员探索由于保鲜用时廷长牛肉片片的硬性、持反击式水轮机、汤色、氮化合物钙含铁铁含铁、ROS、脂质过氮化合物物、MDA、GSH和GPX4层次来估评肌策划 神经组织细胞的铁消亡模式。然而显视,保鲜用时廷长后,牛肉片片的硬性在第四天和第6天为为偏态下跌;持水意识减低;色彩变深,失却光泽度,鲜橘红化为暗橘红。还有就是,氮化合物钙含铁铁、吸附性氧和MDA的含铁为为偏态提高,神经组织细胞凋亡率为为偏态身高。 理论研究的人员转化成各种冷冻箱用时的全身相关肌肉打样定制的血清质,第二步使用SDS-PAGE定量介绍,血清质条带在各种期间数据分布不规则且差不多(图1a)。利用血清在各种打样定制中的表达爱原因,定量介绍遇到同个组打样定制的中数字亲近于同个品质(图1b),就说明全身相关肌肉打样定制血清质享有充分的组内差不多性和组间差别的性。 淀粉酶质组学共监定出1996种淀粉酶质。以B0为参考组,需求B1、B2、B4和B6中的淀粉酶使用差别的理解定性解析,共监定到37几个DEPs。将火山图交互式,并基于FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.055个基准定性解析DEP。效果如1c-f提示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别监定出22、33、73和140个DEPs,进来分刘海别调涨6、11、32和83个,降低16、22、41和5俩个。聚类分析法方式方法考核了各种不同速冻时期段胸肌组织开展中淀粉酶质的理解,效果表示胸肌淀粉酶理解差别的跟随着储藏时期的不断增强而不断增强(图1g)。
图1| 与众不同冷库用时的胸肌样品英文膳食纤维质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 其他冷冻冷藏時间的腿部肌肉图纸地域差异球蛋白数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死蛋白酶肽的PRM参考值解析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG聚集差异化体现淀粉酶的铁去世制度(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT化学发光法核蛋白酶质组学技巧售后业务,拜谱生物水平已产品的研发达成并保持了全面熟的转录组学、核蛋白酶组学、消化吸收组学以其两组学协力产品的技巧售后业务安全体系,欢迎致电咨询!
考生论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.